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lncRNA和microRNA研究
专题简介
miRNA 与lncRNA是基因表达研究中的两个重要内容，它们可在转录水平及转录后水平参与细胞基因表达而影响肿瘤的发生与发展。研究表明，lncRNA可与miRNA结合而竞争性地调控miRNA的功能；同时，miRNA也能够反向调控lncRNA的表达水平而影响细胞的功能。因此，在非编码RNA研究领域内，关注miRNA 与lncRNA相互作用是一个很不错的方向。
miRNA 调控lncRNA 的研究策略
筛选感兴趣的目的基因
第一步
1.基因芯片/测序筛选差异基因
2.QPCR/WB/Northern blot验证差异基因
细胞水平研究目的基因功能
第二步
1.外源性改变基因表达进行功能性获得或是缺失实验
2.CCK8/MTT检测细胞增殖
3.迁移/侵袭检测细胞转移
4.细胞毒性检测验证基因在耐药性中的功能
筛选目的基因调控的miRNA
第三步
1.基因芯片筛选目的基因调控的候选miRNA
2.细胞水平实验验证目的基因与miRNA的靶向性
3.功能学实验（细胞毒性/转移实验）验证靶向性
筛选miRNA调控的lncRNA
第四步
1.数据库/芯片测序筛选与miRNA相作用的候选lncRNA
2.双荧光素酶检测/RNA-pull down验证miRNA 与lncRNA 的靶向性
3.QPCR/Northern blot检测miRNA与lncRNA的相关性
4.功能学实验验证miRNA 与lncRNA 的相关性
实验验证调控关系
第五步
1.肿瘤样本中差异基因-miRNA-lncRNA 的表达检测
2.动物成瘤实验验证差异基因-miRNA-lncRNA之间的相关性