技术服务
circRNA
专题简介
circRNA是一类特殊的非编码RNA分子,近两年成为了RNA领域最新的研究热点。因为circRNA分子呈封闭环状结构,其不受RNA外切酶影响,因此较线性RNA而言不易降解,表达更稳定。近年的研究表明,circRNA分子富含microRNA结合位点,作为ceRNA在胞内发挥miRNA sponge的作用,通过竞争性解除miRNA对其靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达水平,进而在转录水平上对靶基因进行调控,circRNA在诸多疾病如肿瘤的发生和进展过程中中发挥着重要的调控作用。本专题基于对circRNA背景知识的梳理,着重关注circRNA调控microRNA发挥功能的研究策略。
circRNA的特征
1、circRNA结构为环形,较线性RNA更稳定。
2、circRNA主要由外显子环化和内含子环化形成。
3、部分circRNA具有microRNA反应元件(microRNA response element, MRE),可作为ceRNA发挥miRNA sponge的作用。
4、circRNA的表达具有时间和空间特异性。
5、大多数circRNA为内源性ncRNA,部分为外源性circRNA。
6、circRNA在进化上具有保守性,可作为疾病诊断的理想标志物。
circRNA形成机制
根据剪接来源的不同,circRNA可分为外显子环化形成的环状RNA(exonic cirRNAs)和内含子环化形成的环状RNA(ciRNAs)。外显子环状RNA通过反向剪接的方式形成,目前形成机制存在两种假设:
1、在外显子环状RNA形成过程中,前体RNA发生了部分折叠,外显子出现跳跃现象,导致在被跨越的部位形成外显子包含内含子的环状RNA中间体套索结构,套索内部进一步剪接去除内含子序列后形成环状RNA。
2、前体RNA序列两侧内含子上存在的反向互补序列介导环状RNA的形成。

